相比传统手术相比，飞秒激光手术后同样有发生眩光、重影的可能，但由于角膜瓣更光滑，因此手术后发生眩光等现象会少一些，同时，飞秒激光大大缩短了眼干的时间，一般少于三个月。另外，用飞秒激光制作角膜瓣时所使用的吸引环的负压明显低于机械性角膜板层刀制作角膜瓣时的负压。因此，用飞秒激光来制作角膜瓣，可以大大提高准分子激光治疗近视的手术安全性，所以飞秒激光近视眼手术基本是安全的。
术前注意事项
1、戴隐形眼镜的患者应停戴隐形眼镜(软性隐形眼镜2周，硬性隐形眼镜RGP需1个月，OK矫形镜需3个月)后做手术前的检查。
2、手术前1-3天根据医嘱点用抗生素眼药水(氧氟沙星眼液或妥布霉素眼液)。
3、手术应尽量避开经期、孕期、哺乳期。
术后注意事项
1、术后三天内忌进脏水，不要揉眼睛及眼部化妆。
2、一个月内避免用力揉眼、游泳、长时间阅读、看电视及夜晚驾车，防止碰伤眼睛。
3、术后饮食无特殊禁忌。
4、术后复查的时间医生会根据具体情况交待患者。
虽然飞秒激光手术有着一定的后遗症以及不良后果，但是这些都是可以通过一定的方法来预防的，比如说如果在术前做好了充足的准备工作，在术后也做好了护理工作，那么就基本不会发生不良现象了!
