口服苍耳子治疗剂量时，偶见口干、喉燥。吃生苍耳子发病较快，约4～8小时，轻者乏力、精神萎靡、头痛、头晕、食欲不振、恶心、呕吐。重者于发病1～3日出现烦躁不安或嗜睡、昏迷、惊厥、心律失常、黄疸、肝肿大、出血倾向。
临床有误食苍耳子导致肝肾功能衰竭、昏迷、心肌损害、多器官功能衰竭的多篇报道，所以应用该药时一定要慎重，切忌生用或过量使用。苍耳子外用治疗关节炎也是中医常见疗法之一，苍耳子外敷会引起皮损：丘疹、水疱、疼痛、皮疹等，也要引起注意。
一旦出现苍耳子中毒表现：早期宜催吐、洗胃、导泻。严重者应配合静滴高渗糖、维生素K1等;有肝脏损害者，可与还原性谷胱甘肽、甲硫氨基酸治疗;有严重肝肾功能衰竭者，可考虑血液透析;有休克者可给与扩容、纠酸、激素、多巴胺等治疗。
内服苍耳子要依法炮制。严禁食用苍耳幼芽和苍耳子、苍耳子油做的渣饼。
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