钙化灶一般是由炎症和结核引起，如肺结核在治愈后也可形成肺部钙化灶，类似于疤痕。肝内有钙化点可能是肝内胆管壁部分钙化.它的原因多由于炎症、结核等引起，也可能是肝内钙化灶及肝组织局部坏死后的纤维化瘢痕。
肝内钙化灶的病因
一、肝内慢性炎症或创伤。肝内慢性炎症以肝结核和肝脓肿多见，少见于霉菌病、布鲁菌病、门静脉血栓形成和结节性病。这类钙化灶缺乏特征性B超和CT图像，难于与原发性肝癌和肝内转移瘤鉴别。但是，X线平片的诊断很大，平片上50%肝区见均匀弥散于肝左右两叶的钙化灶，90%大小为8~12mm，个别融合性钙化灶可达3~4cm，而且65%患者胸片上可见肺结核征象。
二、寄生虫感染。肝脏寄生虫病也可以出现肝内钙化灶，常见有肝包虫病和肝血吸虫病，前者多见于牧民，后者多为疫区的农民和渔民。肝包虫病肝脏的病灶是无数小囊泡集而成，呈弥漫浸润生长，与正常肝组织界限不清楚，囊璧有钙盐沉积。
三、肝内胆管结石，出现肝内胆管结石后会引起肝脏组织局部坏死的纤维化痕迹，引起结石在阻塞部位的小胆管的扩张。
四、有的是先天发育形成，多是由于在出生之前在子宫内胎儿已经有肝内钙化灶的形成，常合并先天畸形，发现率为0.057%。
五、肝脏上面的一些疾病，是引起肝内钙化灶的常见原因，例如肝囊肿、肝肿瘤、原发性肝癌等。
