指甲盖凹凸不平有小坑可能是营养不良、指甲受伤、真菌感染等因素所致，容易影响指甲的健康。
1、营养不良：如果在日常生活中摄入的营养成分不足，就有可能会导致指甲出现凹凸不平的情况，需要多吃一些优质蛋白类的食物，及时补充身体所需营养。
2、指甲受伤：在指甲受到外力损伤之后，也有可能会导致指甲出现凹凸不平的症状，一般在一段生长之后就会好转。
3、真菌感染：指甲在受到针对感染之后，也有可能会造成灰指甲的症状，而且会造成指甲凹凸不平和指甲发黄。可以在医生指导下通过氟康唑乳膏和酮康唑乳膏、伊曲康唑乳膏等药膏涂抹。
除了以上原因，也不排除是缺乏微量元素等，还需要到医院做检查才能明确。
