比较常见的主要有有慢性前列腺炎、精囊炎等。
慢性前列腺炎的疼痛并不止局限在尿道和会阴，还会向其附近放射，以小腹痛、小腹坠涨、下腰痛最为多见。另外，阴茎、精索、睾丸阴囊、小腹、腹股沟区(大腿根部)、大腿、直肠等处均可受累。需要指出的是，慢性前列腺炎引起的腰痛在下腰部，与骨科原因的腰痛如肌筋膜炎、腰肌劳损等虽易混淆，但后者多在系皮带处附近，较前列腺炎引起的腰痛位置偏高，可以鉴别。
精囊炎：急性者可见下腹疼痛，并牵涉到会阴和两侧腹股沟。慢性者则可出现耻骨上区隐痛，并伴会阴部不适。疼痛症状在射精时明显加剧。
有一些男性在性交后会出现阴茎、小腹疼痛感觉，首先你不必害怕，这是一种正常现象，阴茎在勃起后大量充血，而某些男性回血功能比较弱，造成性交后阴茎、小腹比较涨疼(一般会持续1到3个小时)，这不是大问题。
常见的男性生殖器官感染疾病主要有“五炎”，即睾丸炎、尿道炎、前列腺炎、非细菌性前列腺、附睾炎。
1、睾丸炎：是由各种致病细菌和病毒通过血液、淋巴管与输精管或附睾途径感染引起，其中以腮腺炎引起的睾丸炎最为常见。腮腺炎是病毒引起的急性传染病，成人患腮腺炎后易并发睾丸炎。在急性期，患者表现为阴囊皮肤红肿胀痛，行走时有明显坠胀感觉。若在急性期治疗不当，可转为慢性睾丸炎。
2、附睾炎：是由于尿道狭窄、前列腺增生、尿道炎及感染结核和淋病，通过逆行蔓延引起的。附睾紧贴于睾丸的后外侧，由一条弯曲盘回的附睾管组成，具有促进精子成熟、贮存精子和吸收衰亡精子的重要作用，故双侧附睾有病变时可造成不育。在急性期表现的症状为阴囊肿胀、疼痛，可牵扯下腹部及大腿根部，行走不便。急性期治疗不彻底可转为慢性附睾炎，所以在急性期治疗一定要彻底。
3、前列腺炎：多由尿道炎直接蔓延所致，或是其它组织器官急性炎症经血液及淋巴感染引起，是中青年男性的一种常见病。急性前列腺炎起病急，多表现为全身无力、腰部酸痛，会阴及肛门有不适下坠感，伴有尿痛、尿频、尿急甚至有血尿，有的人性欲减退，出现早泄或阳痿等。
4、非细菌性前列腺炎：有尿频、尿急、性功能障碍等症状，但化验检查不能发现细菌。主要是由于性生活过度、处于性兴奋状态过久或因骑车、骑马使盆腔充血等因素诱发。
5、尿道炎：多系逆行感染，即病菌直接侵入尿道所致。患者在急性期表现为尿道黏膜充血、水肿，或有糜烂溃疡形成，尿道口红肿，有黏液性或脓性分泌物，尿道压痛、变硬;重者可影响到附睾、精索。
男性小腹痛的鉴别诊断
(1) 饱餐、饮酒后突然发作上腹部剧痛，应考虑胃、十二指肠穿孔。
(2) 右上腹痛呈阵发性绞痛，放射至右肩，多为胆囊炎、胆石症。
(3) 上腹正中偏左剧烈腹痛，伴呕吐、疼痛呈持续性痛，阵发性加重，放射到侧腰部，应考虑急性胰腺炎。
(4) 开始在上腹部痛，数小时后转到右下腹痛，伴恶心、呕吐，多为急性阑尾炎。
(5) 侧腹或下腹阵发性绞痛，放射至腰背部、会阴部的，伴有尿频、血尿为输尿管结石。
(6) 腹痛伴腹泻，应考虑肠炎、痢疾、副霍乱等传染病。
(7) 持续腹痛伴呕吐不止的，可能为肠梗阻。
(8)没有患前列腺炎，而是尿道肌肉、前列腺肌肉、或者是会阴部及骨盆底部的肌肉痉挛性疼痛引起的类似于慢性前列腺炎的不适。给这类患者做肛门指检时，前列腺触诊无异常，无压痛，而肛门两侧的提肛肌等处却有较明显的压痛。可判断出这是前列腺痛。
专家指出，不论生殖器官哪个部位出现症状，都会影响性生活甚至引起不育，所以青年在婚后为了维持正常的性生活、保持和谐的夫妻关系、防止性功能障碍和不育，要积极地进行预防和治疗生殖器官感染，而科学的诊疗方法是治愈泌尿生殖感染的关键。
